Validierung von Inventionen (Technologie sowie Produkten) und Entwicklung von Geschäftsmodellideen basierend auf angewandter Grundlagenforschung mit dem Ziel der Weiterentwicklung (Translationsforschung) und Kommerzialisierung. Hierzu werden auch Forschungsdienstleistungen angeboten. Die Gesellschaft strebt nach einer Inkubationsphase an, validierte Geschäftsmodellideen in neue Gesellschaften ausgründen und hierzu Gründerteams zusammenzustellen. Lizenzen und/oder gewerblichen Schutzrechten sowie das entwickelte Know-how sollen auf ausgegründete Unternehmen übertragen werden. Ferner strebt die Aachen Proteineers GmbH an, sich an den Ausgründungen als Gesellschafterin unmittelbar oder mittelbar zu beteiligen (in der Regel 20 %), um prospektive Einnahmen aus diesen Beteiligungen in die Translationsforschung und als (Start-)Kapital in weitere potenziellen Ausgründungen zu investieren. Anwendungsfelder finden sich insbesondere aber nicht ausschließlich in der Medizin, Biotechnologie, Chemie, Bioökonomie und verwandten Industrien. Die Gesellschaft ist befugt, gleichartige oder ähnliche Unternehmen zu erwerben, zu pachten, sich an solchen zu beteiligen, deren persönliche Haftung und Vertretung zu übernehmen, Betriebsstätten und Zweigniederlassungen im In- und Ausland zu errichten sowie alle Geschäfte zu betreiben, die geeignet sind, die Unternehmungen der Gesellschaft zu fördern.
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